Forskningsprosjekter

Forskningsprosjekter

Prosjektpresentasjoner

Figur: sepsisforløp og delprosjekter.
Figur: sepsisforløp og forskningsområder.


Temaer vi forsker på

AnkerEpidemiologi

Vi har gjennom en årrekke forsket på forekomst, dødelighet og konsekvenser av sepsis. I tillegg studerer vi sammenhengen mellom livsstilsfaktorer og risikoen for alvorlige infeksjoner. Vi har blant annet publisert artikler på sammenhengen mellom fedme, fysisk aktivitet, psykisk helse og søvnmangel og fremtidig risiko for sepsis. Gruppen har også hatt fokus på sammenhengen mellom andre indremedisinske tilstander som jernmangelanemi, stoffskiftesykdom og kronisk nyresvikt og utvikling av blodbaneinfeksjoner og sepsis. Til disse studiene har vi brukt klassiske epidemiologiske metoder som Cox-regresjonsanalyser, og også mer moderne metoder som medieringsanalyser og Mendelsk randomisering. 


AnkerHuman genetikk

Human genetikk

Å forstå hvorfor enkelte individer er mer utsatt for alvorlige infeksjoner er avgjørende for å fremme folkehelsen. Vår forskning har som mål å identifisere både genetiske varianter og modifiserbare risikofaktorer som kan påvirke risikoen for å utvikle alvorlige infeksjonssykdommer.

Genome-Wide Association Studies (GWAS)

Vi har undersøkt genetisk predisposisjon for en rekke alvorlige infeksjonssykdommer, inkludert nedre luftveisinfeksjoner (LRTI), øvre urinveisinfeksjoner (UTI), hud- og bløtdelsinfeksjoner (SSTI), blodforgiftning (BSI) og sepsis. Disse studiene har hovedsakelig blitt gjennomført ved hjelp av genome-wide association studies (GWAS), som har som mål å belyse hvordan genetiske varianter bidrar til sykdomsrisiko og å legge grunnlaget for bedre behandlings- og forebyggingsstrategier.

Våre analyser har benyttet genetiske data fra flere store kohorter, inkludert UK Biobank, Trøndelag Helseundersøkelsen (HUNT), FinnGen, Kaiser Permanente og Tromsøundersøkelsen. Gjennom disse studiene har vi identifisert flere genetiske varianter som er assosiert med LRTI, øvre UTI og SSTI. I tillegg har stratifierte GWAS-analyser gitt dypere innsikt i de biologiske mekanismene som ligger til grunn for disse assosiasjonene.

Mendelsk Randomisering (MR)

Å identifisere modifiserbare risikofaktorer for infeksjonssykdommer – særlig alvorlige infeksjoner – er en sentral prioritet innen medisinsk forskning, da det muliggjør målrettede tiltak som kan redusere sykdomsbyrden og forbedre folkehelsen. Mendelsk randomisering (MR) er en robust alternativ metode for å vurdere årsakssammenhenger, spesielt i situasjoner der randomiserte kontrollerte studier (RCT) er uetiske eller upraktiske.

Vi har anvendt MR ved hjelp av genetiske varianter identifisert gjennom GWAS for å undersøke kausale sammenhenger. Gjennom denne tilnærmingen har vi identifisert modifiserbare risikofaktorer for alvorlige infeksjoner som LRTI, øvre UTI, SSTI, BSI og sepsis, som kan være mål for forebyggende strategier.  


AnkerKliniske studier og smittevern

Vi har gjort flere kliniske studier på ulike problemstillinger innen blodbaneinfeksjoner og sepsis. Spesielt har vi hatt søkelys på identifisering av infeksjoner assosiert med intravaskulære katetre, effekten av antibiotikabehandling i samsvar med nasjonale retningslinjer ved sepsis og nytten av å innføre et standardisert sepsisforløp med overvåkningssystem ved sengeposten. “Stopp Sepsis Sykepleier” fikk Forbedringsprisen for 2016 og Norsk Kvalitetspris for helsetjenesten i 2017 for å vise at et målrettet og strukturert arbeid blant sykepleiere reduserte dødeligheten av sepsis. Dette var et samarbeid mellom sykehuset i Levanger, Nord Universitet og Midtnorsk senter for sepsisforskning. Vi har gjennomført både retrospektive studier med gjennomgang av sykehusjournal og prospektive studier som for eksempel studier av kvaliteten på pleien av perifere venekatetre.  

Vi har flere pågående studier på å karakterisere sykdomsforløp i detalj for et stort antall pasienter med sepsis og sammenholde dette med et dypdykk i bakterienes egenskaper, i håp om å finne varselsignal for alvorlig forløp for den enkelte pasienten og for å kartlegge mulige nye behandlingsmål for sepsis. I en pilotstudie undersøker vi den immunmodulerende effekten av et nyutviklet og patentert peptid fra CEMIR, NTNU.  


AnkerMikrobiologi

Interaksjon mellom bakterie og vert: betydningen av bakterie og vert genotype og fenotype ved sepsis (forskningsprosjekt) 

Ved Sykehuset Levanger har man siden 1994 registrert kliniske data og tatt vare på bakterieisolater fra mer enn 5000 pasienter ≥ 18 år fra som har vært innlagt på sykehus i Nord-Trøndelag med blodstrømsinfeksjon (BSI). Kliniske data fra disse pasientene er nå tilgjengelig i et lokalt kvalitetsregister (Sepsisregisteret). Vi holder nå på med to prosjekter hvor vi analyserer kliniske data fra sepsisregisteret mot helgenomsekvensdata for E. coli og S. aureus isolater fra blodkultur. Hovedformålet med prosjektet er å forstå hvordan egenskaper hos bakteriene som er årsak til BSI og sepsis, og egenskaper hos pasientene som får slik infeksjon, influerer på mottakelighet, alvorlighetsgrad og utfall av BSI og sepsis.  

Hurtig dyrkningsuavhengig diagnostikk av blodstrømsinfeksjon og sepsis (innovasjonsprosjekt) 

Det er viktig med hurtig effektiv antibiotikabehandling for å sikre best mulig utfall av alvorlige infeksjoner som blodstrømsinfeksjon (BSI) og sepsis. Tidlig identifikasjon av mikroben som er årsak til infeksjonen er viktig for å kunne målrette behandlingen så tidlig som mulig. Formålet med prosjektet er å undersøke nytten av hurtige dyrkningsuavhengige metoder for påvisning av bakterier og sopp i blod i løpet få timer sammenlignet med blodkultur som tar ett til flere døgn før en får tilsvarende svar. Vi inkluderer pasienter innlagt ved hovedintensivavdelingen og akuttmottaket ved St. Olavs hospital med mistenkt BSI eller sepsis. 

Streptococcus agalactiae- systemisk infeksjon hos voksne

I dette prosjektet beskriver vi forekomsten og dødeligheten ved systemisk Streptococcus agalactiae (gruppe B streptokokker, GBS) infeksjon hos voksne i Norge gjennom perioden 1996-2019, med fokus på faktorer som kan ha betydning for forekomst og utfall av sykdommen. Prosjektet gjennomføres i samarbeid med det nasjonale referanselaboratoriet for GBS ved St. Olavs hospital.

AnkerKunstig intelligens

I dette prosjektet har vi som mål å utvikle redskaper for forebygging og intervensjon hos pasienter med risiko for blodstrømsinfeksjon og sepsis ved bruk av kunstig intelligens. For mer informasjon, se: https://www.ntnu.edu/cosem 
 

Figur/illustrasjon av prosessen med å identifisere sepsis.
 


Effekt av skriftlig veiledning for beste praksis ved Staphylococcus aureus bakteriemi – en retrospektiv observasjonsstudie ved bruk av en stor språkmodell for datauttrekk (innovasjonsprosjekt) 

Denne retrospektive observasjonsstudien har som mål å evaluere effekten av standardisert skriftlig veiledning på håndteringen av Staphylococcus aureus bakteriemi (SAB). Vi sammenligner utfall av sykdomsepisoden og etterlevelse av beste praksis før og etter implementeringen i 2019 ved sykehusene i Helse Møre og Romsdal (HMR HF). I tillegg vil studien undersøke bruken av en stor språkmodell (LLM) som et verktøy for å trekke ut forskningsdata fra elektroniske pasientjournaler (EPJ). 

Dette prosjektet fungerer som en pilot for et innovasjonsinitiativ som har som mål å utvikle et LLM-basert forskningsverktøy og en pipeline for forskning på pasientjournaldata og for kvalitetsforbedring i Helse Midt-Norge.