Faglig innhold

I 'Biopolymere materialer' vil det bli lagt vekt på biologiske makromolekylers egenskaper og oppførsel ved konsentrasjoner over kritisk ovelappkonsentrasjon, så som viskositetprofil, orden/uorden-overganger, geldannelse, viskoelastiske egenskaper og faseoppførsel ved blanding av makromolekyler. Eksempler på anvendelse av biopolymere vil bli gitt med spesiell vekt på biomedisin og biopolymere brukt i immobilisering av celler og enzymer. Demonstrasjon av reologisk utstyr for karakterisering av myke materialer vil bli gitt.

Bioinformatikk: introduksjon til feltet bioinformatikk, som dekker genomsekvenseringsmetoder, genomsamling, sekvensjustering, evolusjon av gensekvenser, proteinstrukturer, annotering av proteinfunksjoner og relevante verktøy og databaser. Utvikling av Python-programmeringsferdigheter ved bruk av Jupyter-miljøet.

Læringsutbytte

Biopolymere materialer: Grunnleggende kunnskap om biologiske biopolymere i konsentrarte løsninger og geler, materialer basert på disse og hvordan slike materialer kan skreddersys og endres til definerte egenskaper.

Bioinformatikk: Studenten forstår genomsekvenseringsmetoder og deres begrensninger. Studenten kan anvende beregningsverktøy for genomsamling og annotering. Studenten kan forklare prinsippene og anvendelsene av sekvensjustering. Studenten kan trekke ut informasjon fra bioinformatiske databaser og skrive Python-skript for å behandle og analysere flere typer data. Studenten kan kombinere data fra forskjellige bioinformatiske databaser for å analysere funksjonen til gener og proteiner.

Læringsformer og aktiviteter

Biopolymere materialer: Forelesninger og demonstrasjoner.

Bioinformatikk: Ukentlige forelesninger (8 x 3 timer) fordelt på teori (1 time) og dataøvelser (2 timer). Gruppeprosjekt og hjemmearbeid (selvstudium).

Anbefalte forkunnskaper

Biopolymere materialer: Det forutsettes normalt kunnskaper i bioteknologiske basisemner tilsvarende TBT4107 Biokjemi 2, TBT4110 Mikrobiologi, TBT4145 Molekylærgenetikk og TBT4135 Biopolymerkjemi.

Bioinformatikk: Introduksjon til Python (TDT4110 eller tilsvarende), Celle- og molekylærbiologi (BI1001 eller tilsvarende), Biokjemi (TBT4102 eller tilsvarende).

Kursmateriell

Biopolymere materialer: Oppgis ved kursstart.

Bioinformatikk: forelesningsslides og dokumentasjon for relevante verktøy og databaser (gitt under forelesningene).

Studiepoengreduksjon