Emne - Bio-system teknologi - TKP4195
TKP4195 - Bio-system teknologi
Om emnet
Vurderingsordning
Vurderingsordning: Samlet karakter
Karakter: Bokstavkarakterer
| Vurdering | Vekting | Varighet | Delkarakter | Hjelpemidler |
|---|---|---|---|---|
| Labprosjekt | 30/100 | |||
| Skriftlig skoleeksamen | 70/100 | 4 timer | E |
Faglig innhold
Faget innholder både teori, øvinger og data labb hvor studenter vil simulere biosystemer. Innføring til modellering og dynamiske systemer. Modellering av Michaelis-Menten kinetikk, phosphoryleringsprosesser, Hill dynamikk, gen regulatoriske nettverker (GRN), mass-action lov, Quasi-steady state, modellering av cellulære signal overføringer, Syntetisk biologi, Modellering av genekspresjon, genetiske kretser, motiver i genetiske kretser som Toggle-switch og oscilasjoner i bakteria, tilbake- og foroverkoblinger. Modellering ved hjelp av matlab programmering, Parameter estimering og kurvetilpasning. Big data analyse: netverkanalyse og simulering, Principle component analysis. Vi skal også lære om bio-systemer og dynamikk: Stabilitet, bi-stabilitet, grensesykluser, svingninger i cellular biologi.
Læringsutbytte
Etter endt emne vil studentene være i stand til å utvikle modeller av bio-systemer, både i molekylær nivå og organisme nivå. Studentene skal forstå effekten av genetiske kretser, og design egne DNA reguleringskretser. De vil også forstå og kunne beskrive dynamiske egenskaper som genetiske switch og svingninger. Samt kunne bruke modeller for å styre cellulære og genetiske prosesser.
Læringsformer og aktiviteter
Forelesninger og øvinger. Øvingene vil være både teoretiske og tekniske. Emnet undervises i hovedsak på norsk, men kan undervises på engelsk dersom det er internasjonale studenter som ønsker å ta emnet.
Mer om vurdering
Skriftlig eksamen teller 70% på total karakteren. Lab-oppgaven teller 30%.
Ved utsatt eksamen (kontinuasjonseksamen) kan skriftlig eksamen bli endret til muntlig eksamen.
Anbefalte forkunnskaper
Biologi/ biokjemi. Molekulær biologi er fordel, men ikke krav. Matematikk i første og andreårskurs anbefales (Matematikk 1, 2 og lineær algebra).
Forkunnskapskrav
Ingen.
Kursmateriell
Forelesningsnotater.
Versjon: 1
Studiepoeng:
7.5 SP
Studienivå: Høyere grads nivå
Termin nr.: 1
Undervises: VÅR 2024
Undervisningsspråk: Engelsk, Norsk
Sted: Trondheim
- Systembiologi
- Teknologiske fag
Eksamensinfo
Vurderingsordning: Samlet karakter
- Termin Statuskode Vurdering Vekting Hjelpemidler Dato Tid Eksamens- system Rom *
- Vår ORD Skriftlig skoleeksamen 70/100 E INSPERA
-
Rom Bygning Antall kandidater - Vår ORD Labprosjekt 30/100 INSPERA
-
Rom Bygning Antall kandidater - Sommer UTS Skriftlig skoleeksamen 70/100 E INSPERA
-
Rom Bygning Antall kandidater
- * Skriftlig eksamen plasseres på rom 3 dager før eksamensdato. Hvis mer enn ett rom er oppgitt, finner du ditt rom på Studentweb.
For mer info om oppmelding til og gjennomføring av eksamen, se "Innsida - Eksamen"