Emne - Bioinformatikk og Usikkerhetsanalyse og forsøksplanlegging, fordypningsemne - TBT4507
TBT4507 - Bioinformatikk og Usikkerhetsanalyse og forsøksplanlegging, fordypningsemne
Om emnet
Vurderingsordning
Vurderingsordning: Samlet karakter
Karakter: Bokstavkarakterer
| Vurdering | Vekting | Varighet | Delkarakter | Hjelpemidler |
|---|---|---|---|---|
| Oppgave | 50/100 | |||
| Skriftlig skoleeksamen | 50/100 | 2 timer | D |
Faglig innhold
Usikkerhetsanalyse og forsøksplanlegging: -Usikkerhetsanalyse -Hypotesetesting -Enkel lineær regresjon -Forsøksplanlegging med to-nivå faktoriell forsøk -Variansanalyse (ANOVA) -Ikke-parametriske metoder -Bruk av Excel og SPSS for statistisk analyse. Bioinformatikk-delen (50 %) gir en omfattende introduksjon til DNA-analyse. Hver student mottar en "rå" DNA-sekvens på ca. 20 kb i størrelse med en opprinnelse (bakteriell, arkeal eller eukaryotisk) som er ukjent for studentene. Studentene analyserer sekvensen basert på et sett av spørsmål gitt i kompendiet. Kurset benytter en praktisk tilnærming til å oppnå alle oppgavene, noe som krever at studentene bruker et bredt spekter av elektroniske bioinformatikkverktøy. Studentene leverer rapporter underveis i semesteret, som hver bygger på den foregående rapporten, og som tilsammen gir grunnlag for vurdering.
Læringsutbytte
Usikkerhetsanalyse og forsøksplanlegging: Studenten har kunnskap om de grunnleggende statistiske modeller og metoder som benyttes innen naturvitenskap og teknologi. Studenten kan tolke resultater av hypotesetesting, regresjonsanalyse, forsøksplanlegging, variansanalyse og ikke-parametriske metoder. Studenten kan bruke dataprogrammer for statistiske beregninger og analyser.
Bioinformatikk: Studenten lærer å lese DNA.
Læringsformer og aktiviteter
Forelesninger (24 t), øvinger (8 t) og selvstudium (64 t).
Bioinformatikk-delen undervises etter prinsippet om problembasert læring.
Obligatoriske aktiviteter
- Øvinger statistikk
Mer om vurdering
Usikkerhetsanalyse og forsøksplanlegging: Antall øvinger er 4, alle må være godkjent for å gå opp til eksamen. Skriftlig eksamen (2t).
Bioinformatikk: Basert på en rapport.
Hver karaktergivende del (skriftlig eksamen i Usikkerhetsanalyse og forsøksplanlegging, rapporten i Bioinformatikk) teller 50 % av karakteren i emnet.
Både rapporten og skriftlig eksamen må være bestått for å få bestått i emnet.
Ved utsatt eksamen kan skriftlig eksamen bli endret til muntlig eksamen.
Spesielle vilkår
Obligatorisk aktivitet fra tidligere semester kan godkjennes av instituttet.
Anbefalte forkunnskaper
Bioinformatikk: Grunnleggende kunnskap innen biokjemi, mikrobiologi og cellebiologi; e.g. TBT4102 Biokjemi 1, TBT4107 Biokjemi 2, TBT4110 Mikrobiologi eller tilsvarende. Grunnkurs i Statistikk fra BSc.
Kursmateriell
Probability and Statistics for Engineers and Scientists (9th Edition) by Ronald E. Walpole.
Bioinformatikk: Oppgis ved kursstart. Studentene benytter åpen tilgjengelige nettsider/programvarer.
Studiepoengreduksjon
| Emnekode | Reduksjon | Fra | Til |
|---|---|---|---|
| BT3220 | 3.7 | HØST 2020 | |
| TBT4506 | 3.7 | HØST 2020 | |
| TBT4508 | 3.7 | HØST 2020 | |
| MATV4008 | 3.7 | HØST 2020 |
Ingen
Versjon: 1
Studiepoeng:
7.5 SP
Studienivå: Høyere grads nivå
Termin nr.: 1
Undervises: HØST 2022
Undervisningsspråk: Engelsk, Norsk
Sted: Trondheim
- Teknologiske fag
Eksamensinfo
Vurderingsordning: Samlet karakter
- Termin Statuskode Vurdering Vekting Hjelpemidler Dato Tid Eksamens- system Rom *
- Høst ORD Skriftlig skoleeksamen 50/100 D 30.11.2022 09:00 INSPERA
-
Rom Bygning Antall kandidater SL120 blå sone Sluppenvegen 14 2 SL310 hvit sone Sluppenvegen 14 9 - Høst ORD Oppgave 50/100
-
Rom Bygning Antall kandidater - Sommer UTS Skriftlig skoleeksamen 50/100 D INSPERA
-
Rom Bygning Antall kandidater
- * Skriftlig eksamen plasseres på rom 3 dager før eksamensdato. Hvis mer enn ett rom er oppgitt, finner du ditt rom på Studentweb.
For mer info om oppmelding til og gjennomføring av eksamen, se "Innsida - Eksamen"