Emne - Bioinformatikk og Forsøksplanlegging og dataanalyse, fordypningsemne - TBT4507
Bioinformatikk og Forsøksplanlegging og dataanalyse, fordypningsemne
Om
Om emnet
Faglig innhold
Forsøksplanlegging og dataanalyse:-Usikkerhetsanalyse,-Hypotesetesting,-Enkel og Multippel lineær regresjon,-Forsøksplanlegging med to-nivå faktoriell forsøk,-Variansanalyse (ANOVA),-Ikke-parametriske metoder,-IBM SPSS for statistisk analyse.
Bioinformatikk-delen (50 %) gir en omfattende introduksjon til DNA-analyse. Hver student mottar en "rå" DNA-sekvens på ca. 20 kb i størrelse med en opprinnelse (bakteriell, arkeal eller eukaryotisk) som er ukjent for studentene. Studentene analyserer sekvensen basert på et sett av spørsmål gitt i kompendiet. Kurset benytter en praktisk tilnærming til å oppnå alle oppgavene, noe som krever at studentene bruker et bredt spekter av elektroniske bioinformatikkverktøy. Studentene leverer rapporter underveis i semesteret, som hver bygger på den foregående rapporten, og som tilsammen gir grunnlag for vurdering.
Læringsutbytte
Forsøksplanlegging og dataanalyse: Studenten har kunnskap om de grunnleggende statistiske modeller og metoder som benyttes innen naturvitenskap og teknologi. Studenten kan tolke resultater av hypotesetesting, regresjonsanalyse, forsøksplanlegging, variansanalyse og ikke-parametriske metoder. Studenten kan bruke dataprogrammer for statistiske beregninger og analyser.
Bioinformatikk: Studenten lærer å lese DNA.
Læringsformer og aktiviteter
Forelesninger (24 t), øvinger (8 t) og selvstudium (64 t).
Bioinformatikk-delen undervises etter prinsippet om problembasert læring.
Obligatoriske aktiviteter
- Øvinger statistikk
Mer om vurdering
Forsøksplanlegging og dataanalyse: Antall øvinger er 4, alle må være godkjent for å gå opp til eksamen. Skriftlig eksamen (2t).
Bioinformatikk: Basert på en rapport.
Hver karaktergivende del (skriftlig eksamen i Forsøksplanlegging og dataanalyse, rapporten i Bioinformatikk) teller 50 % av karakteren i emnet.
Både rapporten og skriftlig eksamen må være bestått for å få bestått i emnet.
Ved utsatt eksamen kan skriftlig eksamen bli endret til muntlig eksamen. Ved stryk eller gjentak kan studenter velge å ta bare én av vurderingsdelene på nytt.
Anbefalte forkunnskaper
Bioinformatikk: Grunnleggende kunnskap innen biokjemi, mikrobiologi og cellebiologi; e.g. TBT4102 Biokjemi 1, TBT4107 Biokjemi 2, TBT4110 Mikrobiologi eller tilsvarende. Grunnkurs i Statistikk fra BSc.
Kursmateriell
Probability and Statistics for Engineers and Scientists (9th Edition) by Ronald E. Walpole.
Bioinformatikk: Oppgis ved kursstart. Studentene benytter åpen tilgjengelige nettsider/programvarer.
Studiepoengreduksjon
| Emnekode | Reduksjon | Fra |
|---|---|---|
| TBT4506 | 3,7 sp | Høst 2020 |
| TBT4508 | 3,7 sp | Høst 2020 |
| MATV4008 | 3,7 sp | Høst 2020 |
Fagområder
- Teknologiske fag
Kontaktinformasjon
Emneansvarlig/koordinator
Faglærere
Ansvarlig enhet
Eksamen
Eksamen
Ordinær eksamen - Høst 2025
Skriftlig skoleeksamen
Oppgitt rom kan endres og endelig plassering vil være klar senest 3 dager før eksamen. Du finner din romplassering på Studentweb.