course-details-portlet

TBT4165 - Systembiologi og biologiske nettverk

Om emnet

Vurderingsordning

Vurderingsordning: Arbeider
Karakter: Bokstavkarakterer

Vurdering Vekting Varighet Delkarakter Hjelpemidler
Arbeider 100/100

Faglig innhold

Emnet gir en innføring i hvordan systembiologiske metoder brukes til å modellere og analysere cellulære nettverk, med spesiell fokus på (1) stokastisk og deterministisk beskrivelse av enkle gen-regulerings kretser, (2) protein interaksjons nettverk og (3) cellulær metabolisme på genom nivå. Studentene vil tilegne seg materialet gjennom forelesninger, praktiske øvingsoppgaver og PC-basert lab. Det legges vekt på en tverrfaglig presentasjon og arbeidsform, slik at emnet skal kunne følges både av informatikere, biologer, kjemikere og fysikere.

Læringsutbytte

Ved avsluttet undervisning skal studentene kunne:
- Forklare grunnleggende begrep, modeller og statistiske mål for å karakterisere egenskaper til generelle nettverk, samt bruke programmet Cytoscape til å analysere empiriske nettverk.
- Forklare og konstruere modeller for små genetiske kretser, analysere deres egenskaper, samt beherske programmet Dizzy for stokastiske simuleringer.
- Gjøre rede for organiseringen og konstruksjon av genom-skala metabolske nettverk, forklare prinsippene for constraint-based analysis (spesielt Flux Balance Analysis), samt beherske COBRA toolbox i MatLab for numerisk analyse av empiriske modeller.

Læringsformer og aktiviteter

Forelesninger, oppgaver og øvinger (PC-lab). Emnet undervises på engelsk.

Obligatoriske aktiviteter

  • Øvinger

Kursmateriell

Oppgis ved kursstart.

Flere sider om emnet

Ingen

Fakta om emnet

Versjon: 1
Studiepoeng:  7.5 SP
Studienivå: Høyere grads nivå

Undervisning

Termin nr.: 1
Undervises:  VÅR 2012

Undervisningsspråk: Engelsk

-

Fagområde(r)
  • Biofysikk
  • Bioinformatikk
  • Biologi
  • Bioteknologi
  • Teknologiske fag
Kontaktinformasjon
Emneansvarlig/koordinator: Faglærer(e):

Ansvarlig enhet
Institutt for bioteknologi og matvitenskap

Eksamensinfo

Vurderingsordning: Arbeider

Termin Statuskode Vurdering Vekting Hjelpemidler Dato Tid Eksamens- system Rom *
Vår ORD Arbeider 100/100
Rom Bygning Antall kandidater
  • * Skriftlig eksamen plasseres på rom 3 dager før eksamensdato. Hvis mer enn ett rom er oppgitt, finner du ditt rom på Studentweb.
Eksamensinfo

For mer info om oppmelding til og gjennomføring av eksamen, se "Innsida - Eksamen"

Mer om eksamen ved NTNU