Emne - Systembiologi og biologiske nettverk - TBT4165
TBT4165 - Systembiologi og biologiske nettverk
Om emnet
Vurderingsordning
Vurderingsordning: Arbeider
Karakter: Bokstavkarakterer
Vurdering | Vekting | Varighet | Delkarakter | Hjelpemidler |
---|---|---|---|---|
Arbeider | 100/100 |
Faglig innhold
Emnet gir en innføring i hvordan systembiologiske metoder brukes til å modellere og analysere cellulære nettverk, med spesiell fokus på (1) stokastisk og deterministisk beskrivelse av enkle gen-regulerings kretser, (2) protein interaksjons nettverk og (3) cellulær metabolisme på genom nivå. Studentene vil tilegne seg materialet gjennom forelesninger, praktiske øvingsoppgaver og PC-basert lab. Det legges vekt på en tverrfaglig presentasjon og arbeidsform, slik at emnet skal kunne følges både av informatikere, biologer, kjemikere og fysikere.
Læringsutbytte
Ved avsluttet undervisning skal studentene kunne:
- Forklare grunnleggende begrep, modeller og statistiske mål for å karakterisere egenskaper til generelle nettverk, samt bruke programmet Cytoscape til å analysere empiriske nettverk.
- Forklare og konstruere modeller for små genetiske kretser, analysere deres egenskaper, samt beherske programmet Dizzy for stokastiske simuleringer.
- Gjøre rede for organiseringen og konstruksjon av genom-skala metabolske nettverk, forklare prinsippene for constraint-based analysis (spesielt Flux Balance Analysis), samt beherske COBRA toolbox i MatLab for numerisk analyse av empiriske modeller.
Læringsformer og aktiviteter
Forelesninger, oppgaver og øvinger (PC-lab). Emnet undervises på engelsk.
Obligatoriske aktiviteter
- Øvinger
Anbefalte forkunnskaper
Basiskunnskaper i molekylærbiologi tilsvarende TBT4145 Molekylærgenetikk, statistikk tilsvarende ST0103 Brukerkurs i statistikk. Noe erfaring i programmering.
Kursmateriell
Oppgis ved kursstart.
Ingen
Versjon: 1
Studiepoeng:
7.5 SP
Studienivå: Høyere grads nivå
Termin nr.: 1
Undervises: VÅR 2012
Undervisningsspråk: Engelsk
-
- Biofysikk
- Bioinformatikk
- Biologi
- Bioteknologi
- Teknologiske fag
Eksamensinfo
Vurderingsordning: Arbeider
- Termin Statuskode Vurdering Vekting Hjelpemidler Dato Tid Eksamens- system Rom *
- Vår ORD Arbeider 100/100
-
Rom Bygning Antall kandidater
- * Skriftlig eksamen plasseres på rom 3 dager før eksamensdato. Hvis mer enn ett rom er oppgitt, finner du ditt rom på Studentweb.
For mer info om oppmelding til og gjennomføring av eksamen, se "Innsida - Eksamen"