Emne - Bioinformatikk - metodeorientert prosjekt - MOL3022
MOL3022 - Bioinformatikk - metodeorientert prosjekt
Om emnet
Vurderingsordning
Vurderingsordning: Oppgave
Karakter: Bestått/ Ikke bestått
| Vurdering | Vekting | Varighet | Delkarakter | Hjelpemidler |
|---|---|---|---|---|
| Oppgave | 100/100 | A |
Faglig innhold
Emnet gir en praktisk og teoretisk introduksjon til sentrale metoder innenfor bioinformatikk, inkludert sekvenssøking, parvis og multippel alignment, fylogenetisk analyse, genprediksjon, ontologi-baserte analyser, motivoppdaging og strukturprediksjon. Studentene får prøve ut de ulike metodene på realistiske problemstillinger gjennom PC-baserte øvinger. Studentene vil også gjennomføre et metodeorientert prosjekt som belyser teorien bak noen sentrale metoder. En individuell rapport fra implementering av en selvvalgt metode vil være basis for karaktersetting. Emnet retter seg særlig mot studenter med informatikk-bakgrunn som ønsker en introduksjon til sentrale metoder som brukes til å analysere molekylærbiologiske data.
Emnet overlapper med MOL3021, med unntak av prosjektoppgaven.
Læringsutbytte
Etter fullført og bestått emne skal studenten kunne:
- forklare hovedprinsippene i viktige algoritmer og metoder brukt i bioinformatiske verktøy, inkludert dynamisk programmering, skjulte Markovmodeller og neurale nett
- forklare funksjon og bruk av viktige bioinformatiske verktøy, særlig verktøy for analyser på sekvensnivå (genom, gen, RNA og protein)
- beskrive viktige formater for lagring og utveksling av bioinformatiske data
- beskrive innhold og bruk av viktige bioinformatiske databaser og web-portaler
- anvende bioinformatiske verktøy og databaser til å analysere relevante molekylærbiologiske data
Læringsformer og aktiviteter
Forelesninger og øvinger (PC-lab). Undervisningen blir gitt intensivt over 2 uker i vårsemesteret, og inkluderer innledende arbeid med prosjektoppgaven.
Undervisningen foregår på engelsk.
Obligatoriske aktiviteter
- Øvinger
Mer om vurdering
Vurderingen gjøres på basis av prosjektoppgaven. Det er mulig å få tilbakemelding på prosjektarbeidet og rapporten før innlevering. For eventuell ny vurdering i påfølgende semester må det leveres en ny rapport, og tema for prosjektet må være forskjellig fra det foregående prosjektet. Undervisningen blir gitt på engelsk. Eksamen må også besvares på engelsk.
Anbefalte forkunnskaper
Basiskunnskaper i molekylærbiologi, statistikk og informatikk.
Kursmateriell
Oppgis ved semesterstart.
Studiepoengreduksjon
| Emnekode | Reduksjon | Fra | Til |
|---|---|---|---|
| MOL3021 | 7.5 | HØST 2015 | |
| MOL3019 | 7.5 | HØST 2016 | |
| MTEK3001 | 7.5 | HØST 2016 | |
| BT3220 | 3.7 | HØST 2018 |
Ingen
Versjon: 1
Studiepoeng:
7.5 SP
Studienivå: Høyere grads nivå
Termin nr.: 1
Undervises: VÅR 2024
Undervisningsspråk: Engelsk
Sted: Trondheim
- Molekylærmedisin
- Medisinsk teknologi
- Bioinformatikk
- Biologi
- Bioteknologi
- Informatikk
- Medisin
Eksamensinfo
Vurderingsordning: Oppgave
- Termin Statuskode Vurdering Vekting Hjelpemidler Dato Tid Eksamens- system Rom *
-
Vår
ORD
Oppgave
100/100
A
Innlevering
11.04.2024
INSPERA
23:59 -
Rom Bygning Antall kandidater
- * Skriftlig eksamen plasseres på rom 3 dager før eksamensdato. Hvis mer enn ett rom er oppgitt, finner du ditt rom på Studentweb.
For mer info om oppmelding til og gjennomføring av eksamen, se "Innsida - Eksamen"