Navigasjon

  • Hopp til innhold
NTNU Hjemmeside NTNU Hjemmeside

ntnu.no

  • Studier
    • Studere på NTNU
    • Finn studieprogram
    • Søke opptak
    • Videreutdanning og deltid
    • Forkurs og oppfriskning
  • Studentliv
    • Student i Gjøvik
    • Student i Trondheim
    • Student i Ålesund
  • Forskning og innovasjon
    • Forskning
    • Innovasjon
    • Satsingsområder
    • Toppforskning
    • Ekspertlister
    • Ph.d.
  • Om NTNU
    • Fakulteter og institutter
    • Sentre
    • Bibliotek
    • Kart
    • Ledige stillinger
    • Arrangement
    • Nyheter
    • Kontakt oss
    • Om NTNU
  1. Ansatte

Språkvelger

English

Emily Anne Hartop

Last ned pressefoto
Last ned pressefoto
Foto:

Emily Anne Hartop

Førsteamanuensis
Institutt for naturhistorie
NTNU Vitenskapsmuseet

emily.hartop@ntnu.no
A204 Schøninghuset Kalvskinnet, Trondheim
Google Scholar Onsager Fellowship Programme Outstanding Academic Fellow
Om Forskning Publikasjoner Undervisning Formidling

Om

Jeg kommer opprinnelig fra California, hvor jeg tok en bachelorgrad i entomologi ved University of California, Riverside. Senere arbeidet jeg med BioSCAN‑prosjektet ved Natural History Museum of Los Angeles, hvor jeg ble svært interessert i den hyperdiverse fluefamilien Phoridae – et modell-eksempel på mørkt takson.

I 2017 fikk jeg et stipend fra Svenska artprojektet for å arbeide med materiale av pukkelfluer fra Svenska Malaisefälleprojektet ved Station Linné på Öland. Dette arbeidet ble en del av doktorgradsavhandlingen min i Ronquist-laben ved Stockholms universitet. Avhandlingen tok for seg spørsmål knyttet til mangfoldet hos pukkelfluer, men utviklet dessuten integrative metoder for å håndtere mørke taksa – artsrike og tallrike grupper som er dårlig kjent, fordi de er vanskelig å studere.

Mitt arbeid med mørke taksa utviklet seg da jeg fikk en stilling ved Center for Integrative Biodiversity Discovery ved Museum für Naturkunde i Berlin fra 2021 til 2024. Der brukte teamet vårt molekylære teknikker i kombinasjon med robotikk og maskinlæring for å akselerere biodiversitetsforskningen.

I 2024 begynte jeg ved NTNU som Onsager Fellow. Målet her er å lede et team med fagfolk som deler interessen for å utforske jordens mest artsrike og tallrike taksa, gjennom integrative og tverrfaglige perspektiver.

Jeg foretrekker å bli kontaktet på engelsk.

Forskning

  • Machine Vision for Natural History
  • Integrative Taxonomy and DNA Barcoding

Publikasjoner

Resolving biology’s dark matter: species richness, spatiotemporal distribution, and community composition of a dark taxon

We use megabarcoding to assess a model dark taxon, investigating species diversity, variation across time and space, and the environmental drivers. We demonstrate how dark taxon research can provide critical insights in the era of climate change.

Opportunity in our Ignorance: Urban Biodiversity Study Reveals 30 New Species and One New Nearctic Record for Megaselia (Diptera: Phoridae) in Los Angeles (California, USA).

Description of thirty new species of scuttle flies from Los Angeles using a table-based description system.

The Swedish Malaise Trap Project: A 15 Year Retrospective on a Countrywide Insect Inventory.

Everything you'd want to know about one of the most ambitious insect inventories of all time.

Towards Large-scale Integrative Taxonomy (LIT): resolving the data conundrum for dark taxa.

Systematic and integrative approach to discovering and delimiting species in hyperdiverse groups.
  • Kronologisk
  • Etter kategori
  • Alle publikasjoner i Nasjonalt vitenarkiv (NVA)

2026

  • Caruso, Valerio; Disney, Ronald Henry; Whitmore, Daniel; Bøggild, Esben; Grundmann, Bernd; Hartop, Emily Anne. (2026) Updating and expanding the key to European Megaselia (Diptera, Phoridae): from Disney’s Britain to a continental fauna, with 393 additions and four new species. European Journal of Taxonomy
    Vitenskapelig artikkel
  • Williamson, David; Hartop, Emily Anne; Speed, James. (2026) Learning from Digital Collections: Digitisation and Machine Learning for Large-Scale Museum Studies. Biodiversity Information Science and Standards (BISS)
    Vitenskapelig artikkel

2025

  • H., Nowak, Karol; Hartop, Emily Anne; Monika, Prus-Frankowska,; Mateusz, Buczek,; R., Kolasa, Michał; Tomas, Roslin,; Otso, Ovaskainen,; Piotr, Łukasik,. (2025) What lurks in the dark? An innovative framework for studying diverse wild insect microbiota. Microbiome
    Vitenskapelig artikkel
  • Ekrem, Torbjørn; Hartop, Emily Anne; Aspaas, Aina Mærk. (2025) Finn arten med DNA-strekkoding.
    Utstilling

2024

  • Li, Xuankun; Hash, John M.; Hartop, Emily Anne; Yang, Ding; Smith, Paul T.; Brown, Brian V.. (2024) A molecular phylogeny of scuttle flies (Diptera: Phoridae) unveils extensive concordance but intriguing divergences from morphological results. Systematic Entomology
    Vitenskapelig artikkel
  • Hartop, Emily Anne; Lee, Leshon; Srivathsan, Amrita; Jones, Mirkka; Peña-Aguilera, Pablo; Ovaskainen, Otso Tapio; Roslin, Tomas; Meier, Rudolf. (2024) Resolving biology’s dark matter: species richness, spatiotemporal distribution, and community composition of a dark taxon. BMC Biology
    Vitenskapelig artikkel
  • Meier, Rudolf; Hartop, Emily Anne; Pylatiuk, Christian; Srivathsan, Amrita. (2024) Towards holistic insect monitoring: Species discovery, description, identification and traits for all insects. Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Biological Sciences
    Vitenskapelig oversiktsartikkel
  • Riccardi, Paula Raile; Hartop, Emily Anne. (2024) Large-scale integrative taxonomy of Swedish grass flies (Diptera, Chloropidae) reveals hitherto unknown complexity of a dark taxon. Zoologica Scripta
    Vitenskapelig artikkel
  • Caruso, Valerio; Hartop, Emily Anne; Chimeno, Caroline; Noori, Sajad; Srivathsan, Amrita; Haas, Michael; Lee, Leshon; Meier, Rudolf; Whitmore, Daniel. (2024) An integrative framework for dark taxa biodiversity assessment at scale: A case study using Megaselia (Diptera, Phoridae). Insect Conservation and Diversity
    Vitenskapelig artikkel

Tidsskriftspublikasjoner

  • Caruso, Valerio; Disney, Ronald Henry; Whitmore, Daniel; Bøggild, Esben; Grundmann, Bernd; Hartop, Emily Anne. (2026) Updating and expanding the key to European Megaselia (Diptera, Phoridae): from Disney’s Britain to a continental fauna, with 393 additions and four new species. European Journal of Taxonomy
    Vitenskapelig artikkel
  • H., Nowak, Karol; Hartop, Emily Anne; Monika, Prus-Frankowska,; Mateusz, Buczek,; R., Kolasa, Michał; Tomas, Roslin,; Otso, Ovaskainen,; Piotr, Łukasik,. (2025) What lurks in the dark? An innovative framework for studying diverse wild insect microbiota. Microbiome
    Vitenskapelig artikkel
  • Williamson, David; Hartop, Emily Anne; Speed, James. (2026) Learning from Digital Collections: Digitisation and Machine Learning for Large-Scale Museum Studies. Biodiversity Information Science and Standards (BISS)
    Vitenskapelig artikkel
  • Li, Xuankun; Hash, John M.; Hartop, Emily Anne; Yang, Ding; Smith, Paul T.; Brown, Brian V.. (2024) A molecular phylogeny of scuttle flies (Diptera: Phoridae) unveils extensive concordance but intriguing divergences from morphological results. Systematic Entomology
    Vitenskapelig artikkel
  • Hartop, Emily Anne; Lee, Leshon; Srivathsan, Amrita; Jones, Mirkka; Peña-Aguilera, Pablo; Ovaskainen, Otso Tapio; Roslin, Tomas; Meier, Rudolf. (2024) Resolving biology’s dark matter: species richness, spatiotemporal distribution, and community composition of a dark taxon. BMC Biology
    Vitenskapelig artikkel
  • Meier, Rudolf; Hartop, Emily Anne; Pylatiuk, Christian; Srivathsan, Amrita. (2024) Towards holistic insect monitoring: Species discovery, description, identification and traits for all insects. Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Biological Sciences
    Vitenskapelig oversiktsartikkel
  • Riccardi, Paula Raile; Hartop, Emily Anne. (2024) Large-scale integrative taxonomy of Swedish grass flies (Diptera, Chloropidae) reveals hitherto unknown complexity of a dark taxon. Zoologica Scripta
    Vitenskapelig artikkel
  • Caruso, Valerio; Hartop, Emily Anne; Chimeno, Caroline; Noori, Sajad; Srivathsan, Amrita; Haas, Michael; Lee, Leshon; Meier, Rudolf; Whitmore, Daniel. (2024) An integrative framework for dark taxa biodiversity assessment at scale: A case study using Megaselia (Diptera, Phoridae). Insect Conservation and Diversity
    Vitenskapelig artikkel

Kunstneriske produksjoner

  • Ekrem, Torbjørn; Hartop, Emily Anne; Aspaas, Aina Mærk. (2025) Finn arten med DNA-strekkoding.
    Utstilling

Undervisning

Emner

  • BI2001 - Biosystematikk og biomangfold i tid og rom

Formidling

Vox's Quest for a New Species

Follow along as I work with Vox to find a new species in NYC's Central Park!

L.A.'s Back-yard Entomologists

New Yorker article about 30 new species of scuttle flies described from L.A.

Thirty new fly species in Los Angeles

Science feature "in other journals".

In defense of flies. Yes, really.

Vox article about the fascinating world of flies.

The search for Earth’s most mysterious creatures is turning up extraordinary results

Vox article about the global hunt for dark taxa.

DNA barcodes jump-start search for new species

Science article on accelerating biodiversity science with barcodes.

2026

  • Annen presentasjon
    Hartop, Emily Anne; Veer, Eva van der; Benichou, Laurence; Koureas, Dimitris; Puillandre, Nicolas; Stathi, Iasma; Williamson, David R.. (2026) Future Developments in Integrative Taxonomy. CETAF 59th General Assembly
  • Annen presentasjon
    Woxen, Thomas Wetteland; Herfindal, Ivar; Hartop, Emily Anne. (2026) Exploring the concept of rarity in dark taxa. Gjærvollkonferansen 2026 - Norsk natur i 2050

2025

  • Konferanseforedrag
    Hartop, Emily Anne; Williamson, David R.. (2025) The R.H.L. Disney Phoridae Collection: Evolving a Legacy for the Taxonomic Future. Dipterists Forum Annual Meeting
  • Konferanseforedrag
    Hartop, Emily Anne; Williamson, David R.. (2025) Too Many Flies, Too Few Taxonomists: Let Machines Do the Boring Bits. Norsk symposium i biosystematikk
  • Annen presentasjon
    Hartop, Emily Anne. (2025) Dark Taxa are a THING. Invited Talk, Wellcome Sanger Institute
  • Konferanseposter
    Williamson, David R.; Welch, Mark; Connolly, Erin M.; Yiu, Anna; Hartop, Emily Anne. (2025) Museum Collections and the Taxonomic Future of Dark Taxa: Phoridae as a testcase. Dipterists Day

2024

  • Foredrag
    Ekrem, Torbjørn; Hartop, Emily Anne; Prestø, Tommy; Vinje, Christina; Martin, Michael David; Morin Lagos, Jaime Gerardo; Stavø, Tuva Olsen; Alsli, Lise Mariann Bolstad; Bruce, Camilla. (2024) Jul i VIMU magasinet: Reinsdyr, småkryp og julens krydder. Omvisninger i samlingene
  • Foredrag
    Hartop, Emily Anne. (2024) GLOW: Evolving workflows for Dark Taxon Biology. Institute of Biology Seminar
  • Konferanseforedrag
    Hartop, Emily Anne. (2024) A Dark Decade: Progress on the world's most intractable "genus" (Diptera: Megaselia). 9th International Barcode of Life Conference
  • Foredrag
    Hartop, Emily Anne. (2024) Megabarcoding with ONT. Seminar for NIBIO Svanhovd
  • Konferanseforedrag
    Hartop, Emily Anne. (2024) Webinar on DNA-barcoding using nanopores: Bridging theory to real-world implementation. Online Webinar for iBOL EUROPE
  • Foredrag
    Ekrem, Torbjørn; Prestø, Tommy; Hassel, Kristian; Hartop, Emily Anne; Bakken, Torkild; Grankvist, Maria Buhaug. (2024) Terrors from Land and Sea - A journey into Nature’s Nightmares. Omvisning med foredrag i naturhistoriske samlinger
  • Foredrag
    Ekrem, Torbjørn; Prestø, Tommy; Hassel, Kristian; Hartop, Emily Anne; Bakken, Torkild; Buhaug, Maria Grankvist. (2024) Grøss og gru fra hav og land - En reise i naturens mareritt. Omvisning med foredrag i naturhistoriske samlinger
  • Foredrag
    Ekrem, Torbjørn; Hartop, Emily Anne; Aspaas, Aina Mærk. (2024) Finn arten med DNA-strekkoding. Ungdommens forskernatt ved NTNU

NTNU – Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet

  • For ansatte
  • |
  • For studenter
  • |
  • Innsida
  • |
  • Canvas

Studere

  • Om studier
  • Studieprogram
  • Emner
  • Videreutdanning
  • Karriere

Aktuelt

  • Nyheter
  • Arrangement
  • Jobbe ved NTNU

Om NTNU

  • Om NTNU
  • Bibliotek
  • Strategi
  • Forskning
  • Satsingsområder
  • Innovasjon
  • Organisasjonskart
  • Utdanningskvalitet

Kontakt

  • Kontakt oss
  • Finn ansatte
  • Spør en ekspert
  • Pressekontakter
  • Kart

NTNU i tre byer

  • NTNU i Gjøvik
  • NTNU i Trondheim
  • NTNU i Ålesund

Om nettstedet

  • Bruk av informasjonskapsler
  • Tilgjengelighetserklæring
  • Personvern
  • Ansvarlig redaktør
Facebook Instagram Linkedin Snapchat Tiktok Youtube
Logg inn
NTNU logo