Emne - Anvendt bioinformatikk og systembiologi - MTEK3001
Anvendt bioinformatikk og systembiologi
Om
Om emnet
Faglig innhold
Emnet gir innføring i bruk av sentrale metoder innenfor bioinformatikk, inkludert sekvenssøking, parvis og multippel alignment, fylogenetisk analyse, genprediksjon og strukturprediksjon. Bruken av metodene settes inn i en systembiologisk sammenheng, og ontologier, storskala-analyser og studier av komplekse systemer vil bli diskutert. Studentene får prøve ut metodene på realistiske problemstillinger gjennom PC-baserte øvinger. Det legges vekt på en tverrfaglig presentasjon og arbeidsform, slik at emnet skal kunne følges både av informatikere og medisinere / molekylærbiologer med de anbefalte forkunnskapene.
Læringsutbytte
Målet med emnet er å gi studentene grunnleggende innføring i praktisk bruk av bioinformatiske metoder, inkludert systembiologiske prinsipper, slik at studentene kan bruke relevante metoder på egne problemstillinger.
Læringsformer og aktiviteter
Forelesninger og øvinger (PC-lab). Undervisningen starter i februar. Utsatt eksamen vil være muntlig. Undervisningen og eksamen foregår på engelsk.
Obligatoriske aktiviteter
- Øvinger
Anbefalte forkunnskaper
Basiskunnskaper i molekylærbiologi tilsvarende Molekylærbiologi for teknologer, statistikk tilsvarende Brukerkurs i statistikk og informatikk tilsvarende Informasjonsteknologi grunnkurs.
Kursmateriell
Oppgis ved semesterstart.
Studiepoengreduksjon
| Emnekode | Reduksjon | Fra |
|---|---|---|
| MOL3019 | 7,5 sp | |
| MOL3021 | 7,5 sp | |
| MOL3022 | 7,5 sp |
Fagområder
- Bioinformatikk
- Biologi
- Bioteknologi
- Informatikk
- Medisin
- Medisinsk teknologi
- Molekylærmedisin