Emne - Metabolomics- Metoder og praktisk anvendelse - MEDT8010
MEDT8010 - Metabolomics- Metoder og praktisk anvendelse
Om emnet
Vurderingsordning
Vurderingsordning: Hjemmeeksamen
Karakter: Bestått/Ikke bestått
Vurdering | Vekting | Varighet | Delkarakter | Hjelpemidler |
---|---|---|---|---|
Hjemmeeksamen | 100/100 | 3 uker |
Faglig innhold
Metabolisme (stoffskifte) er et komplett sett av livsnødvendige kjemiske reaksjoner som skjer i levende celler. Metabolomics er det systematiske studiet av metabolske profiler i biologiske prøver og vev. Det er den nyeste av omics metodene, og er et komplementært verktøy til genomics og proteomics innenfor systembiologi.
Kurset skal gi deltakerne en innføring i metabolomics. Formålene er å gi deltakerne kjennskap til avanserte NMR og MS metoder, inkludert praktisk erfaring i prosessering og analyse av slike data, brukt i metabolomics.
Teoretiske og praktiske aspekter ved disse metodene, inkludert prøvepreparering, data innsamling, prosessering og videre analyse vil bli gjennomgått.
Kurset vil også dekke NMR og MS basert metabolomics anvendt på mange forskjellige prøvetyper. Krav, informasjonsinnhold, i tillegg til styrker og svakheter i metabolomics vil også bli gjennomgått.
Betydningen av metabolomics i biologisk og medisinsk forskning samt klinisk bruk vil bli illustrert.
Læringsutbytte
Etter fullført og bestått emne skal studenten:
1 Forstå prinsippene i metabolomics.
2 Kunne bedømme hvilket metodedesign (inkl. prøveprosessering, metodevalg og analyse) som vil være best egnet for en gitt problemstilling.
3 Kunne anvende avanserte NMR og MS metoder
4 Kunne analysere og tolke NMR og MS data
5 Kunne kritisk vurdere resultater og publikasjoner innen metabolomics
6 Kunne sammenfatte et minireview over et fritt valgt tema innenfor metabolomics, og formidle dette på nivå for et internasjonalt tidsskrift
Læringsformer og aktiviteter
Forelesninger, gruppearbeid med gjennomgang av relevante artikler og praktiske demonstrasjoner/øvinger. Det tas forbehold om minimum 4 deltagere for å arrangere kurset. Hvis ingen engelskspråklige studenter deltar vil store deler av kurset bli undervist på norsk.
Kurset planlegges gjennomført som et intensivkurs, til sammen 6 fulle dager fordelt på 2 uker. Disse ukene kan enten være påfølgende uker, eller med noen ukers mellomrom.
Arbeidsbelastningen skal knyttes til følgende aktiviteter:
- forelesninger (32 timer)
- øvinger (gruppearbeid som resulterer i skriftlig oppsummering som gjøres mellom de to intensivukene + presentasjon siste uke, 10 timer)
- laboratoriearbeid (16 timer)
- selvstudium (130 timer)
- hjemmeeksamen
Oppmøte på forelesninger, øvinger og lab er obligatorisk, og en forutsetning for å få gjennomføre hjemmeeksamen.
Obligatoriske aktiviteter
- Forelesninger
- Lab
- Øvinger
Anbefalte forkunnskaper
Noe praktisk/teoretisk kunnskap innen høyoppløselig kjernemagnetisk resonans spektroskopi (NMR/MRS), gass/væske kromatografi (GC/LC) og massespektrometri (MS).
Forkunnskapskrav
Utdanning tilsvarende mastergradnivå / høyskole. Medisinerstudenter opptatt på Forskerlinjen. Andre med redusert kompetanse etter individuell vurdering.
Kursmateriell
Undervisningsmateriell vil bli lagt ut på It's learning.
Ingen
Versjon: 1
Studiepoeng:
7.5 SP
Studienivå: Doktorgrads nivå
Termin nr.: 1
Undervises: HØST 2015
Undervisningsspråk: Engelsk
-
- Biofysikk og medisinsk teknologi
- Bioinformatikk
- Biokjemi
- Biomedisinsk teknikk
- Bioteknologi
- Medisin
- Medisinsk teknologi
- Beathe Sitter
- May-Britt Tessem
- Ola Dale
- Per Bruheim
- Siver Andreas Moestue
- Tone Frost Bathen
Ansvarlig enhet
Institutt for sirkulasjon og bildediagnostikk
Eksamensinfo
Vurderingsordning: Hjemmeeksamen
- Termin Statuskode Vurdering Vekting Hjelpemidler Dato Tid Eksamens- system Rom *
- Høst ORD Hjemme-eksamen 100/100
-
Rom Bygning Antall kandidater
- * Skriftlig eksamen plasseres på rom 3 dager før eksamensdato. Hvis mer enn ett rom er oppgitt, finner du ditt rom på Studentweb.
For mer info om oppmelding til og gjennomføring av eksamen, se "Innsida - Eksamen"