Håvard Takle Lindholm
Om
Denne nettsiden blir ikke lenger oppdatert da jeg har begynt som postdoctoral fellow under Daniel De Carvalho hos Princess Margaret Cancer Centre i Canada. Se under for informasjon fra før jeg flyttet.
Jeg var en del av Menno Oudhoffs lab ved Centre of Molecular Inflammation Research (CEMIR) hvor jeg forske på hvordan epitelcellene i tarmen forandrer seg når de møter på en utfordring i miljøet rundt seg. Dette kan f.eks. være under en infeksjon eller pga. andre faktorer. Min spesialitet er å bruke informatikk, som f.eks. sekvenseringsanalyse og bildeanalyse, for å svare på relevante biologiske spørsmål om hvordan cellene i tarmen forandrer og utvikler seg.
Forskningsinteresser:
- Rollen til epigenetiske regulatorer under respons på skade i epitelcellene i tarmen
- Hvordan signaler fra immunsystemet påvirker epitelcellene i tarmen
Metoder/verktøy jeg bruker:
- Organoidekulturer av tarmceller
- Sekvenseringsanalyse, f.eks. RNAseq og ChIPseq
- Nevrale nettverk
- Bildesegmentering
Publikasjoner
2022
-
Lindholm, Håvard Takle;
Parmar, Naveen;
Drurey, Claire;
Poveda, Marta Campillo;
Vornewald, Pia;
Ostrop, Jenny;
Sanchez, Alberto Diez;
Maizels M, Rick;
Oudhoff, Menno.
(2022)
BMP signaling in the intestinal epithelium drives a critical feedback loop to restrain IL-13-driven tuft cell hyperplasia.
Science immunology.
volum 7 (71).
Vitenskapelig artikkel
2021
-
Alonso, Mara Martin;
Iqbal, Sharif;
Vornewald, Pia;
Lindholm, Håvard Takle;
Damen, Mirjam J.;
Martínez, Fernando;
Hoel, Sigrid;
Sanchez, Alberto Diez;
Altelaar, Maarten;
Katajisto, Pekka;
Arroyo, Alicia G.;
Oudhoff, Menno.
(2021)
Smooth muscle-specific MMP17 (MT4-MMP) regulates the intestinal stem cell niche and regeneration after damage.
Nature Communications.
volum 12 (1).
Vitenskapelig artikkel
-
Lindholm, Håvard Takle;
Oudhoff, Menno J..
(2021)
Defining changes in the intestinal epithelium in early life and in response to infections.
2021. ISBN 978-82-326-5687-5.
Doktorgradsavhandling
-
Ostrop, Jenny;
Zwiggelaar, Rosalie Theda Margien;
Terndrup Pedersen, Marianne;
Gerbe, François;
Bösl, Korbinian;
Lindholm, Håvard Takle;
Díez-Sánchez, Alberto;
Parmar, Naveen;
Radetzki, Silke;
von Kries, Jens P.;
Jay, Philippe;
Jensen, Kim B.;
Arrowsmith, Cheryl;
Oudhoff, Menno.
(2021)
A semi-automated organoid screening method demonstrates epigenetic control of intestinal epithelial differentiation.
Frontiers in Cell and Developmental Biology.
volum 8:618552.
Vitenskapelig artikkel
-
Drurey, Claire;
Lindholm, Håvard Takle;
Oudhoff, Menno;
Maizels, Rick.
(2021)
Intestinal epithelial tuft cell induction is negated by a murine helminth and its secreted products.
Journal of Experimental Medicine (JEM).
publications.INTERVJUSKRIFTL
-
Parmar, Naveen;
Burrows, Kyle;
Vornewald, Pia;
Lindholm, Håvard Takle;
Zwiggelaar, Rosalie Theda Margien;
Sanchez, Alberto Diez;
Alonso, Mara Martin;
Fosslie, Madeleine Lystad;
Vallance, Bruce A.;
Dahl, John Arne;
Zaph, Colby;
Oudhoff, Menno.
(2021)
Intestinal-epithelial LSD1 controls goblet cell maturation and effector responses required for gut immunity to bacterial and helminth infection.
PLoS Pathogens.
volum 17 (3).
Vitenskapelig artikkel
2020
-
Zwiggelaar, Rosalie;
Lindholm, Håvard Takle;
Fosslie, Madeleine Lystad;
Pedersen, Marianne Terndrup;
Ohta, Yuki;
Sanchez, Alberto Diez;
Martin Alonso, Mara;
Ostrop, Jenny;
Matano, Mami;
Parmar, Naveen;
Kvaløy, Emilie;
Spanjers, Roos;
Nazmi, Kamran;
Rye, Morten Beck;
Drabløs, Finn;
Arrowsmith, Cheryl H;
Dahl, John Arne;
Jensen, Kim B.;
Sato, Toshiro.
(2020)
LSD1 represses a neonatal/reparative gene program in adult intestinal epithelium.
Science Advances.
volum 6 (37).
Vitenskapelig artikkel
Tidsskriftspublikasjoner
-
Lindholm, Håvard Takle;
Parmar, Naveen;
Drurey, Claire;
Poveda, Marta Campillo;
Vornewald, Pia;
Ostrop, Jenny;
Sanchez, Alberto Diez;
Maizels M, Rick;
Oudhoff, Menno.
(2022)
BMP signaling in the intestinal epithelium drives a critical feedback loop to restrain IL-13-driven tuft cell hyperplasia.
Science immunology.
volum 7 (71).
Vitenskapelig artikkel
-
Alonso, Mara Martin;
Iqbal, Sharif;
Vornewald, Pia;
Lindholm, Håvard Takle;
Damen, Mirjam J.;
Martínez, Fernando;
Hoel, Sigrid;
Sanchez, Alberto Diez;
Altelaar, Maarten;
Katajisto, Pekka;
Arroyo, Alicia G.;
Oudhoff, Menno.
(2021)
Smooth muscle-specific MMP17 (MT4-MMP) regulates the intestinal stem cell niche and regeneration after damage.
Nature Communications.
volum 12 (1).
Vitenskapelig artikkel
-
Ostrop, Jenny;
Zwiggelaar, Rosalie Theda Margien;
Terndrup Pedersen, Marianne;
Gerbe, François;
Bösl, Korbinian;
Lindholm, Håvard Takle;
Díez-Sánchez, Alberto;
Parmar, Naveen;
Radetzki, Silke;
von Kries, Jens P.;
Jay, Philippe;
Jensen, Kim B.;
Arrowsmith, Cheryl;
Oudhoff, Menno.
(2021)
A semi-automated organoid screening method demonstrates epigenetic control of intestinal epithelial differentiation.
Frontiers in Cell and Developmental Biology.
volum 8:618552.
Vitenskapelig artikkel
-
Drurey, Claire;
Lindholm, Håvard Takle;
Oudhoff, Menno;
Maizels, Rick.
(2021)
Intestinal epithelial tuft cell induction is negated by a murine helminth and its secreted products.
Journal of Experimental Medicine (JEM).
publications.INTERVJUSKRIFTL
-
Parmar, Naveen;
Burrows, Kyle;
Vornewald, Pia;
Lindholm, Håvard Takle;
Zwiggelaar, Rosalie Theda Margien;
Sanchez, Alberto Diez;
Alonso, Mara Martin;
Fosslie, Madeleine Lystad;
Vallance, Bruce A.;
Dahl, John Arne;
Zaph, Colby;
Oudhoff, Menno.
(2021)
Intestinal-epithelial LSD1 controls goblet cell maturation and effector responses required for gut immunity to bacterial and helminth infection.
PLoS Pathogens.
volum 17 (3).
Vitenskapelig artikkel
-
Zwiggelaar, Rosalie;
Lindholm, Håvard Takle;
Fosslie, Madeleine Lystad;
Pedersen, Marianne Terndrup;
Ohta, Yuki;
Sanchez, Alberto Diez;
Martin Alonso, Mara;
Ostrop, Jenny;
Matano, Mami;
Parmar, Naveen;
Kvaløy, Emilie;
Spanjers, Roos;
Nazmi, Kamran;
Rye, Morten Beck;
Drabløs, Finn;
Arrowsmith, Cheryl H;
Dahl, John Arne;
Jensen, Kim B.;
Sato, Toshiro.
(2020)
LSD1 represses a neonatal/reparative gene program in adult intestinal epithelium.
Science Advances.
volum 6 (37).
Vitenskapelig artikkel
Rapport
-
Lindholm, Håvard Takle;
Oudhoff, Menno J..
(2021)
Defining changes in the intestinal epithelium in early life and in response to infections.
2021. ISBN 978-82-326-5687-5.
Doktorgradsavhandling