Håvard Takle Lindholm
Bakgrunn og aktiviteter
Jeg er en del av Menno Oudhoffs lab ved Centre of Molecular Inflammation Research (CEMIR) og jeg forsker på hvordan epitelcellene i tarmen forandrer seg når de møter på en utfordring i miljøet rundt seg. Dette kan f.eks. være under en infeksjon eller pga. andre faktorer. Min spesialitet er å bruke informatikk, som f.eks. sekvenseringsanalyse og bildeanalyse, for å svare på relevante biologiske spørsmål om hvordan cellene i tarmen forandrer og utvikler seg.
Forskningsinteresser:
- Rollen til epigenetiske regulatorer under respons på skade i epitelcellene i tarmen
- Hvordan signaler fra immunsystemet påvirker epitelcellene i tarmen
Metoder/verktøy jeg bruker:
- Organoidekulturer av tarmceller
- Sekvenseringsanalyse, f.eks. RNAseq og ChIPseq
- Nevrale nettverk
- Bildesegmentering
Vitenskapelig, faglig og kunstnerisk arbeid
Et utvalg av nyere tidsskriftspublikasjoner, kunstneriske produksjoner, bok, inklusiv bokdeler og rapport-del. Se alle publikasjoner i databasen
Tidsskriftspublikasjoner
- (2021) A semi-automated organoid screening method demonstrates epigenetic control of intestinal epithelial differentiation. Frontiers in Cell and Developmental Biology. vol. 8:618552.
- (2020) LSD1 represses a neonatal/reparative gene program in adult intestinal epithelium. Science Advances. vol. 6 (37).