Emner

Faglig innhold

Emnet tar for seg algoritmiske metoder med anvendelser innen bioinformatikk, med et spesielt fokus på strengbehandling.

Læringsmål

Studenten skal kunne anvende, og til dels modifisere, kjente metoder for å løse bioinformatiske problemer. Det vil også bli lagt noe vekt på selvstendig og kreativ anvendelse av generelle algoritmiske metoder.

Læringsformer og aktiviteter

Forelesninger og øvinger. Hvis få studenter tar emnet kan forelesningene erstattes med kollokvier. Ved utsatt eksamen (kontinuasjonseksamen) kan skriftlig eksamen bli endret til muntlig eksamen.

Obligatoriske aktiviteter

• Øvinger

Anbefalte forkunnskaper

Emne TDT4120 Algoritmer og datastrukturer.

Forkunnskapskrav

Kursmateriell

Jones & Pevzner: An introduction to bioinformatics algorithms (MIT Press, 2004). Artikler og utdelt materiale. (Det tas forbehold om endringer.)