Emnet tar for seg algoritmiske metoder med anvendelser innen bioinformatikk, med et spesielt fokus på strengbehandling.
Læringsmål
Studenten skal kunne anvende, og til dels modifisere, kjente metoder for å løse bioinformatiske problemer. Det vil også bli lagt noe vekt på selvstendig og kreativ anvendelse av generelle algoritmiske metoder.
Læringsformer og aktiviteter
Forelesninger og øvinger. Hvis få studenter tar emnet kan forelesningene erstattes med kollokvier. Ved utsatt eksamen (kontinuasjonseksamen) kan skriftlig eksamen bli endret til muntlig eksamen.
Obligatoriske aktiviteter
Anbefalte forkunnskaper
Emne TDT4120 Algoritmer og datastrukturer.
Forkunnskapskrav
-
Kursmateriell
Dan Gusfield: Algorithms on Strings, Trees and Sequences: Computer Science and Computational Biology (Cambridge University Press, 1997). (Det tas forbehold om endringer.)