Prosjekt: Modellering og optimalisering av mikrobielle konsortier som produserer mellomkjede karboksylater av cellulose

Mellomkjedede karboksylater, som kaproat og kaprylsyre, er produkter med et bredt spekter av bruksområder, inkludert som insektmidler og (etter omdannelse) som drivstoff eller medisin. De kan produseres gjennom karboksylatplattformen, der et mikrobielt bakteriesamfunn bryter ned cellulose og fermenter sukkerkomponentene. Spesiene i et slikt samfunn lever i forskjellige typer symbiose og kan samarbeide ved å utveksle metabolitter eller konkurrere om begrensede ressurser. Mikrobielle samfunn eksisterer i alle kroker og kroker i verden, inkludert magen til virveldyr og jord. Deres effektive samarbeid, stabilitet mot forstyrrelser og et bredt spekter av metabolske funksjoner gjør dem ideelle for bruk i komplekse prosesser, for eksempel i karboksylatplattformen.

Motivasjonen bak prosjektet er å utnytte resursene i bioavfallet som produseres hvert år, som ellers sendes til deponi. Det er et samarbeid kalt Cell4Chem under ERA CoBiotech -paraplyen, med partnere i Tyskland, Frankrike, Spania og Slovenia. Min oppgave er å generere og bruke matematiske metabolske modeller i genomskala for å veilede utformingen av det ideelle mikrobielle samfunnet.

Veileder: Daniel Machado