FUGE nasjonale teknologiplattformer
I funksjonell genomforskning er det behov for avansert og kostbar teknologi som hele tiden er under utvikling. Plattformene og nodene som er opprettet under FUGE programmet tilbyr tjenester innen mange av disse teknologiene. Nedenfor er en oppsummering av nodene som finnes i Midt-Norge.
BioCore - Bioinformatics Core Facility - Leder: Prof Finn Drabløs (IKM/DMF)
Tilgjengelige tjenester ved Trondheims-noden:
- Data analyse basert på evolusjonære metoder
- Veldig raske søke metoder
- Sekvens analyse, fold recognition, homologi modellering
PROMEC - Proteomics and Metabolomics Core Facility - Leder: Prof. Geir Slupphaug (IKM/DMF)
Tjenester tilgjengelig ved noden:
- Identifikasjon av proteiner separert med 1D/2D-PAGE
- Identifikasjon av bestemte post-translasjonelle modifikasjoner
- De-novo sekvensering
- 2D-DIGE -analyse
- Opplæring i proteinidentifikasjon fra massespektrometrigenererte sekvensdata
Celle- og vevs imaging - Leder: Prof. Catharina de Lange Davies (IFY/NT)
Celle- og vevs imaging noden har avansert utstyr for mikroskopering:
- flere konfokal laser scanning microskoper
- multiphoton mikroskop
- fluorescence correlation spektroskopi
- total internal reflection mikroskopi
- atomic force mikroskopi.
MR - Core Facility - Leder: Prof. Olav Haraldseth (ISB/DMF)
Denne noden har en MR scanner for små dyr og jobber med FUGE relaterte prosjekter som ønsker å bruke MR imaging og/eller spektroskopi.
GCF - Genomics Core Facility - Leder: prof. Arne Sandvik (IKM/DMF)
Denne noden er en del av NTNU Genomics Resource Center .
Services available:
- NMC in-house spotted microarrays
- Custom microarrays service
- Scanning service
- Expression profiling service (RNA-in-DATA out)
- Genomic profiling service (DNA-in DATA out)
- Bioinformatic service
Transkripsjonelt analysesenter for planter - Leder: Prof. Atle Bones (IBI/NT)
Tilgjengelige tjenester er:
- Mikroarrayanalyser ved hjelp av semi-automatic hybridization station og Agilent microarray scanner.
- RNA isolering
- Kultivering av planter under kontrollerte omgivelser i vekstskap.
Biobanker - Leder: Prof. Kristian Hveem (ISM/DMF)
Biobanken lagrer blodprøver og klargjør for utlevering biologisk materiale til godkjente forskningsprosjekter.
Dersom du ønsker mer informasjon om de nasjonale FUGE plattformene med tilhørende noder kan du lese mer på Norges Forskningsråd sine sider.
