Det medisinske fakultet har enhetlig ledelse med dekanus Stig A. Slørdahl som øverste leder. Den faglige aktiviteten er organisert i fem institutter, som igjen er inndelt i faggrupper og sentre. Administrasjonen ledes av administrasjonskoordinator Arild Skaug Hansen
Fakultetsledelsen, fem instituttledere og administrasjonskoordinator utgjør ledergruppen ved Det medisinske fakultet.
Det medisinske fakultet har et fakultetsstyre med eksterne og interne medlemmer.
Dekani vedtak
Det er innført enhetlig ledelse ved NTNU. For å tydeliggjøre beslutningslinjene og sørge for god intern kommunikasjon, informasjon og medvirkning, vil alle vedtak som vurderes å være av prinsipiell betydning for Det medisinske fakultet, legges ut på nett.