iGEMNTNU2012

I konkurransen international Genetically Engineered Machine (iGEM) skal lagene utvikle "biologiske maskiner" ved å manipulere celler slik at de får nye egenskaper. NTNU iGem har i år valgt kreft som tema siden dette er ett av de største helseproblemene i verden.

Modifiserer E.coli-bakterier

Kreftceller er svært vanskelige å drepe uten at det samtidig påvirker andre celler i kroppen. Tanken bak prosjektet hos NTNU iGEM er å modifisere en E.coli-bakterie til å respondere på faktorer som er spesifikke for områder hvor kreftceller/tumor befinner seg. I området omkring kreftcellene vil det ofte være lavt nivå av oksygen, og høyt nivå av laktat (melkesyre). Det er disse faktorene E.coli-cellen skal respondere på.

Bakteriene skal i tillegg produsere ett toksin som er giftig for kreftcellen. Idèen er at når de modifiserte cellene oppdager områder med lav konsentrasjon av oksygen og høy konsentrasjon av laktat, vil det sette i gang en mekanisme som trigger lysisgener.  Lysisgenene fører til at cellene sprekker slik at de kan slippe ut giftstoffet rett ved kreftcellene.

Europeisk delfinale i oktober

Lagene definerer prosjektene sine selv, og utvikler dem fra idéstadiet til å bli et system som fungerer i en celle. Arbeidet foregår i sommerferien, og når arbeidet starter får alle lag utdelt et sett med standardiserte DNA-biter som kan settes sammen på nye måter.

iGEM-laget startet planleggingen av prosjektet på vårparten i 2012, og i midten av juni var labarbeidet i full gang. Laget skal jobbe med prosjektet på fulltid til midten av august. Utover høsten skal de legge siste finpuss på prosjektet, og den første helgen i oktober reiser de til Amsterdam for å delta i iGEMs europeiske delfinale.

Der skal laget presentere prosjektet sitt foran alle de andre deltagende lagene og dommere. Dersom laget når målet sitt om en gullmedalje kjemper de om en plass i verdensfinalen som foregår i Boston på det velkjente universitetet MIT.

NTNUs deltakere

NTNU stiller i år med lag for andre gang.

Årets lag består av fem studenter fra siv. ing. bioteknologi og én student fra siv. ing. fysikalsk kjemi. Lagets leder er avgangsstudent Gunvor Røkke (bioteknologi), som også deltok på fjorårets lag. Veiledere på prosjektet er Eivind Almaas, Rahmi Lale, Martin Hohman-Mariott, Marius Eidsaa og Marit Otterlei.